Pellegrini v prezidentské kampani kritizoval rozhodnutí české vlády přerušit konzultace se slovenským kabinetem premiéra Roberta Fica kvůli rozdílným názorům na klíčová témata zahraniční politiky. V souvislosti s válkou na Ukrajině Pellegrini sám v minulosti tvrdil, že český prezident Petr Pavel by rád bojoval.
Pellegrini obhajuje rozhodnutí Ficovy vlády zastavit ze slovenských státních zásob dodávky zbraní Ukrajině. Vyslovil se za zastavení palby v sousední zemi a za zahájení mírových jednání.
Bratislava a Praha se nyní výrazně liší právě v názoru na válku na Ukrajině. Česko nyní například stojí za iniciativou nakoupit v zemích mimo Evropskou unii munici pro Ukrajinu.
