Závěr života Krčín strávil na tvrzi v Obděnicích, kde i zemřel. Dodnes není známo přesné datum jeho skonu a ani místo, kde jsou jeho ostatky.

Hrobka je v Kostele Nanebevzetí Panny Marie. Sonda podle Šindeláře ukázala, že pohřební komora byla luxusně upravená, omítnutá a načisto vybílená, a podle všech indicií ji nedal postavit nikdo jiný než Krčín.

Dnes se podařilo vytvořit 3D skeny celého prostoru komory. Opravdu se ukázala jako prázdná, dodal archeolog. Na podlaze, na níž jsou patrné zásahy, zůstaly zbytky zetlelého dřeva. Jejich původ by mělo pomoci určit další zkoumání. Co se stalo s ostatky, nemáme tušení, doplnil Šindelář.

Jakub Krčín z Jelčan a Sedlčan (1535 až 1604) studoval vodohospodářství na Karlově univerzitě v Praze, studium ale nedokončil. Roku 1561 vstoupil do služeb Rožmberků. Postupně se stal regentem rožmberského panství. Věnoval se výstavbě a rozšíření rybníků na Třeboňsku, navázal tak na Josefa Štěpánka Netolického. Roku 1571 založil rybník Nevděk (dnešní Svět), kvůli kterému dal zbourat část Třeboně. Šest let budoval největší rybník Rožmberk, nacházející se přímo na Lužnici. V Sedlčanech vybudoval pivovar, panský mlýn a sádky na ryby.